尚书府，最让人津津乐道的是沈文祁的两位掌上明珠，一个冰雪聪慧，一个鬼马精灵，两位大小姐都非池中之物，妹妹沈甄看到姐姐即便是嫁人，依然将药店生意打理的井井有条，她钦佩姐姐打理药店的能力，羞愧自己什么都不会，但是沈姌却鼓励她作好自己，只要长姐能干，妹妹自然也能安枕无忧。
烟雨蒙蒙，沈甄来到庭院，看到山茶花开得正艳，担心花骨朵被雨滴侵扰，她立刻将手中的雨伞给它们撑上，爹爹又在伏案设计图纸，这次爹爹首创了火地龙，沈甄欣喜地看着爹爹的设计图，父亲正聊着已经为沈甄准备好了生辰礼物，忽然门外一片喧嚣，陆时砚带着一群人马踏门而入。陆时砚宣读奏折，沈甄的爹爹因为设计的城西渠坍塌，死伤严重，现在要缉拿归案，准备严加审理。
沈文祁非常诧异，图纸是他亲手设计，经过几次实验才开始施工，不可能有误，但圣命难为，沈文祁临走时将一个令牌塞在沈甄手中。父亲被抓走，沈甄连夜想办法，看到令牌，或许和城西渠有关，想到此沈甄立刻去李府找长姐，但是长姐的婆婆唯恐惹祸上身，立刻关紧大门，不准沈姌外出半步。
陆时砚昨夜梦中遇刺，醒来时胸口依然隐隐作痛，深夜接到任务外出，刚好执行公务的就是尚书府，看到尚书府梨花带雨的二小姐，恻隐之心油然而生，将沈文祁带走时，刚好与沈甄四目相对，陆时砚胸口剧痛，立刻晕倒在地。醒来之后，找了很多个大夫诊治，都诊不出毛病，有的问诊之后，竟然结论是心病，让陆时砚颇为无语。
到了第二天，周御史来见陆时砚，称城西渠的案子皇帝已经移交给他们审理，陆时砚甚是奇怪，昨日他详细看了看沈文祁亲手绘制的城西渠图样，发现并没有不妥之处，然而工图不翼而飞，怎么后来会发生坍塌事故，实在是离奇，但如今皇帝让周御史审理，陆时砚自然是不好再说什么。
沈甄第二天去找姑妈商量，无意中听到姑父正在怂恿姑妈把她嫁人，平日沈文祁没有遇难，对方就提过亲被拒绝，如今看到尚书府刚刚落了难，便又开始咄咄逼人。沈甄知道姑妈的耳根软，她开始拼命想办法，让姑妈带她去市集吃面，拗不过沈甄的哀求，姑妈终于同意了。
沈甄故意在面馆中问父亲的案件，姑妈神情紧张，提醒她这里人多眼杂，不便多说，但是沈甄看到陆时砚刚巧也来吃面，索性就再问问陆时砚案件进展，然后将姑妈推上前，趁着众人不防备，立刻带着丫鬟离开了。
沈甄来到钱库，按照父亲给的钥匙上号码，找到了一个木匣，正小心翼翼抱在怀里准备打开，忽然陆时砚径直站在她面前，提醒沈甄不可私藏证据，随后开始争夺木匣，争抢中，木匣坠地，发出一声脆响。原本以为父亲会给自己留什么证据，谁知里面竟然是一封母亲的亲笔信，丧母多年，每逢沈甄的生辰总会收到一封母亲的信笺，这次父亲还把母亲送她的玉镯放入木匣，可惜被摔碎了。
捡拾起玉镯的残片，沈甄眼眶都红了，陆时砚把皇帝亲赐的玉佩送给她作为弥补，沈甄断然拒绝，每次见到陆时砚总会有不好的事情发生，沈甄气的泪如雨下，沈姌随后赶来，带着沈甄离开。陆时砚刚好看到沈甄佩戴的玉佩，这和他梦中被行刺的凶手佩戴的一模一样！陆时砚忍不住猜测，莫非沈甄就是令他屡屡犯心病之人。不远处，沈甄忍不住向阿姐啜泣，哭声传来，陆时砚再次心痛倒地。
今日是沈甄的生辰，长姐沈姌给她做了长寿面，安抚沈甄不要难过，至少家里还有长姐，只要父亲的设计图没错，她们只需要寻找证据便是。
御史台，沈甄的父亲被人暗中下毒，幸好狱卒发现及时，才没有性命之忧，周御使从衙役那里得知混入牢狱的罪犯畏罪自杀，认罪书中称自己是城西渠中受难的家属，因为对沈文祁怀恨在心，便以身犯险。这其中必然有诈，周御使正思忖，忽然听到门外一阵喧闹。
沈姌亲自探狱，被狱卒挡在门外，并不曾进入，沈姌平日里精通律例，直接指出狱卒并没有权利阻止人探狱。周御使来到沈姌面前，听到她将律例背诵得滚瓜烂熟，立刻指责狱卒实则，并且按照律例罚了俸禄。
沈甄在家里思来想去，依然觉得父亲有东西寄放在金氏钱庄，正准备带着丫鬟再去钱庄调查一番，家里来了一些衙役，非要抄家找证据，沈甄着急出去，但来者是陆时砚，对方叮嘱手下仔细搜查，并且盯上了她身上佩戴的香囊，陆时砚拿到香囊，本以为是装的毒药迷香，谁知竟然普通寻常。
陆时砚来搜查了一遍，杳无发现后便准备拿着香囊回去，沈甄挡在面前，索要自己的香囊，确实没有必要搜走女工物品，陆时砚把东西还了回去，沈甄直接当着众人的面给扔了。
待陆时砚走后，沈甄急匆匆带着丫鬟去钱庄，她凭借着记忆，找到八号抽屉，打开锁片，果真发现有父亲的东西，是一份详细的工图，应该是一份很重要的证据，沈甄知道现在处境危险，并不能将工图全身而退，便又把工图锁了起来，但她不知道，已经有人暗中盯上她，并且紧随其后，把工图给盗走了。
沈甄还没有走出钱庄，发现内门被锁，钱庄忽然走水，里面乌烟瘴气，沈甄慌忙去找八号抽屉，但上了锁，自己费了很大功夫并不曾打开，并且有人明目张胆开始将她推搡到重灾区，就在这时，陆时砚经过，看到钱庄走水，外面还有沈甄的丫鬟，立刻冲进去将沈甄救了，几个掳走沈甄的人看到陆时砚出手敏捷，赶紧逃走，陆时砚将八号抽屉打开，里面空无一物，他们迅速觉得案件非同小可。
陆时砚问刚刚想要掳走沈甄的人特征，沈甄推测应该和肃宁侯府有关，刚才在浓烟中，她闻到一股奇异的香味，这种香料只有她姐姐一个人会调制，并且这钱庄就是姑父开的，沈甄分析得井井有条，陆时砚答应沈甄帮助她寻找证据，但是唯一的要求是让沈甄现在哭一下，沈甄被陆时砚的提议弄得莫名奇妙，况且没有来由要哭一下，陆时砚便给她制造伤感气氛，回想起家中最近遭遇的变故，沈甄潸然泪下，而陆时砚的胸口又开始作痛，他立刻喊停，让沈甄不要再哭了。
工图被盗，当今最重要的是找到证据，为了证明自己猜测，决定大胆尝试一下验证自己的猜测。不入虎穴焉得虎子，沈甄跑去姑母家，称自己刚刚在钱庄遇难，险些被害，姑母表面上关怀备至，立刻让手下给沈甄沐浴更衣，姑母从小看着她长大，沈甄觉得姑母应该还是爱她的，但紧接着发生的事实却让她心寒。
姑妈在沈甄沐浴之后，暖心安慰，还给她换上漂亮衣服，让她去客房休息，谁知不一会许威径直走入房间。沈甄喝止许威不该趁人之危，但对方寡廉鲜耻，根本不听，身边没有工具，沈甄只得假意逢迎，然后给自己争取时间想办法。
许威称拿到工图的就是沈甄的姑父，只要沈甄肯乖乖听话委身于他，自己一定让工图完璧归赵，沈甄表现得弱不禁风，提议许威共饮交杯酒，然后趁其不防备，夺门跑出去。沈甄来到姑母的花园，许威连同下人依然步步紧逼，沈甄恳求姑母救命，但对方无动于衷，姑父还称能被许威看上是莫大的福气。许威当众要来霸王上弓，沈甄拼死反抗不肯屈服，眼见衣服就要被扯坏，幸好陆时砚来了！
擅闯肃宁侯府是重罪，陆时砚推说接到举报，在侯府有重要证据，沈甄的姑父自知理亏，不敢叫板，而许威调戏良家妇女也被带了下去，沈甄不停在哭泣，陆时砚叮嘱她不要哭了，一边心痛难忍晕倒。
陆时砚在肃宁伯府中搜查出工图，将沈甄叫去问是不是真迹，想到父亲曾经为了这张工图呕心沥血了两年，沈甄忍不住潸然泪下，情之所动，沈甄的流泪自然能够理解，但是陆时砚却牵连到心口痛，他立刻叮嘱沈甄不要再哭了。
掌握到肃宁伯府有内情，陆时砚立刻带肃宁伯严加审问，许侍郎原名许威，强抢名女这条罪状任谁说出去都是丑闻一件，陆时砚吃准了皇后不会为这种事求情，便让手下给了许威两鞭子。原本这许威就是纨绔子弟，根本经不住下，才两鞭子便昏死过去。肃宁伯称自己收到了几封书信，上面叮嘱他拿到工图可保钱庄财源滚滚，不然会让他家破人亡，肃宁伯利欲熏心，立刻按照书信中的内容照做。
周述安来见陆时砚，将沈文祁在狱中被下毒的事情说了，提醒陆时砚今后要步步小心，如今皇帝命令陆时砚和周述安一起查案。陆时砚觉得这件事暂时还是不要告诉沈甄，省得她在伤心垂泪，祸及自己。
沈甄一哭陆时砚就心痛不迭，在陆时砚看来可不是件好事，他命令四五个女侍去给沈甄检查身体，看沈甄是不是异于常人，但几名女侍却回禀沈甄四肢纤细，身材姣好，并且髋骨很宽，适合生养。这些话刚好被沈甄的婢女清溪听到，她误会陆时砚也是一个登徒子，立刻向自己的主人禀告。
堂堂七尺男儿的廷尉竟然也犯花痴，沈甄心中大骇，不一会儿，陆时砚径直前来，沈甄开始加倍防范，陆时砚立刻解释，事情并非沈甄想的那样，只是自己见不得沈甄哭泣，如果想要尽快调查冤案真相，希望沈甄能够解决他的问题。
听到只要自己哭泣陆时砚便会心痛，沈甄非常惊讶，当场实验下，发现陆时砚果真紧捂胸口不久晕倒在地，沈甄选择相信陆时砚的话，但是清溪觉得还是需要再次尝试，沈甄便拿来了更多的洋葱和辣椒芥末，虽然味道刺鼻，鼻涕眼泪不停，但很快陆时砚便紧跟过来，恳求沈甄不要再流泪了，他一定会想尽办法帮助沈文祁沉冤昭雪。
深夜，陆时砚再次入梦，香火缭绕，他步入其中，希望有仙人指路，一位鹤发童颜的仙人点拨“相思入骨药石无医”，醒来之后，陆时砚百般不得其解，在梦中他见到的那名女子好像曾经因为他受到了伤害，并且受尽酷刑，好像自己很对不起他，但是为什么总是在梦中想起，陆时砚还是无解。
到了天亮，陆时砚又去见了神婆，这神婆先是开导陆时砚或许平日里办案太多，压力太大，但陆时砚坦言他梦中的女子竟然和现实中的一模一样，只要一掉眼泪自己便心痛，神婆神色大变，觉得陆时砚和那个女子前世有孽缘，今世是来讨债的。陆时砚不相信，但见到神婆振振有词，还让沈甄第二天见她，便会帮助陆时砚解决这个燃眉之急。
神婆叮嘱陆时砚，待她帮助陆时砚了断与沈甄之间的孽缘，两个人今后便会形同陌路，陆时砚听得很清楚，依然带着沈甄如约而至。